Simulation ab initio de molecules d'intérêt biologique : Modes de vibrations pour la spectroscopie infrarouge » książka
Simulation ab initio de molecules d'intérêt biologique : Modes de vibrations pour la spectroscopie infrarouge
ISBN-13: 9783838144801 / Francuski / Miękka / 2018 / 180 str.
Simulation ab initio de molecules d'intérêt biologique : Modes de vibrations pour la spectroscopie infrarouge
ISBN-13: 9783838144801 / Francuski / Miękka / 2018 / 180 str.
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Les expA(c)riences de spectroscopie vibrationnelle, infrarouge et Raman, permettent d'obtenir des renseignements structuraux au niveau molA(c)culaire. Les simulations de dynamique molA(c)culaire ab initio permettent de reproduire ces spectres mais leur interprA(c)tation reste un dA(c)fi. Dans le cadre de ce travail, nous prA(c)sentons une mA(c)thode originale d'analyse vibrationnelle A partir de dynamiques molA(c)culaires A tempA(c)rature finie, qui gA(c)nA(c)ralise les modes normaux A des systA]mes anharmoniques. A l'aide de ces modes de vibration effectifs nous pouvons ensuite dA(c)terminer les intensitA(c)s et les largeurs de chacune des bandes d'absorption infrarouges. En application, nous A(c)tudions des peptides de tailles croissantes, en insistant sur la nature et les intensitA(c)s des modes Amides, et concluons par la comparaison de spectres infrarouges de sucres fucoses sulfatA(c)s, afin de caractA(c)riser les spectres d'absorption de 3 anomA]res.
Les expériences de spectroscopie vibrationnelle, infrarouge et Raman, permettent dobtenir des renseignements structuraux au niveau moléculaire. Les simulations de dynamique moléculaire ab initio permettent de reproduire ces spectres mais leur interprétation reste un défi. Dans le cadre de ce travail, nous présentons une méthode originale danalyse vibrationnelle à partir de dynamiques moléculaires à température finie, qui généralise les modes normaux à des systèmes anharmoniques. A laide de ces modes de vibration effectifs nous pouvons ensuite déterminer les intensités et les largeurs de chacune des bandes dabsorption infrarouges. En application, nous étudions des peptides de tailles croissantes, en insistant sur la nature et les intensités des modes Amides, et concluons par la comparaison de spectres infrarouges de sucres fucoses sulfatés, afin de caractériser les spectres dabsorption de 3 anomères.
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