Les sA(c)quences rA(c)pA(c)tA(c)es en tandem sont une classe de sA(c)quences gA(c)nA(c)tiques constituA(c)es de motifs adjacents dont font partie microsatellites et minisatellites. Dans cet ouvrage, nous traitons le problA]me de leur comparaison par alignement. Notre modA]le considA]re, en plus des trois opA(c)rations classiques: mutation, insertion et dA(c)lA(c)tion, l'amplification en tandem et la contraction en tandem. L'amplification copie un facteur de la sA(c)quence, c'est-A -dire un ou plusieurs caractA]re(s), et met le ou les exemplaire(s) du facteur copiA(c) A cAtA(c) du facteur...