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Die Identifizierung der längsten gemeinsamen Teilsequenz (LCS) biologischer Sequenzen hat bedeutende Anwendungen in der Bioinformatik. Aufgrund des zunehmenden Wachstums von Bioinformatik-Anwendungen werden neue biologische Sequenzen mit größerer Länge für die Verarbeitung verwendet, was eine große Herausforderung für sequenzielle LCS-Algorithmen darstellt. Es wurden zwar einige parallele LCS-Algorithmen vorgeschlagen, deren Effizienz und Effektivität sind jedoch angesichts der zunehmenden Komplexität und Größe biologischer Daten nicht zufriedenstellend. Um die Einschränkungen...

L'identification de la plus longue sous-séquence commune (LCS) des séquences biologiques a des applications importantes en bio-informatique. En raison de la croissance émergente des applications bio-informatiques, de nouvelles séquences biologiques plus longues ont été utilisées pour le traitement, ce qui représente un défi de taille pour les algorithmes LCS séquentiels. Quelques algorithmes LCS parallèles ont été proposés, mais leur efficacité et leur efficience ne sont pas satisfaisantes compte tenu de la complexité et de la taille croissantes des données biologiques. Afin...

The Longest Common Subsequence(LCS) identification of biological sequences has significant applications in bioinformatics. Due to the emerging growth in bioinformatics applications, new biological sequences with longer length have been used for processing, making it great challenge for sequential LCS algorithms. Few parallel LCS algorithms have been proposed but their efficiency and effectiveness are not satisfactory with increasing complexity and size of biological data. To overcome limitations of existing LCS algorithms and considering MapReduce programming model as promising technology for...