Baza Danych Ligandów Bialek » książka
Baza Danych Ligandów Bialek
ISBN-13: 9783639891836 / Polski / Miękka / 2014 / 56 str.
Niniejsza praca stanowi opis zrealizowanych przez autora projektow dotycz cych zagadnienia wspomaganego komputerowo projektowania lekow. Projekty b d ce tematem pracy to baza danych ligandow bia ek LIGANSdb oraz program do analizy rozk adu oddzia ywa w bia ku o nazwie PDP 1.0 (Potencial Density In Protein). LIGANDSdb to serwis internetwy dost pny pod adresem http: //crick.cm-uj.krakow.pl/ligandsdb. LIGANDSdb posiada dwa rodzaje przeszu-kiwania zasobow: przeszukiwanie po nazwach bia ek dostarczaj ce listy ligandow, ktore wi si z dan protein oraz przeszukiwanie po nazwach ligandow ktorego rezultatem jest lista bia ek, do ktorych dany ligand si wi e. Dodatkowo przy ka dym bia ku za czona jest informacja o pe nionej funkcji biologicznej oraz o kodzie EC bia ka je eli kod taki posiada. Serwis ten powsta w oparciu o baz danych PDB, a konkretnie w oparciu o ok. 25 tys. struktur kompleksow bia ko ligand. PDP 1.0 to program do analizy rozk adow oddzia ywa w bia ku z naciskiem na ob-szar miejsca wi cego ligand."
Niniejsza praca stanowi opis zrealizowanych przez autora projektów dotyczących zagadnienia wspomaganego komputerowo projektowania leków. Projekty będące tematem pracy to baza danych ligandów białek LIGANSdb oraz program do analizy rozkładu oddziaływań w białku o nazwie PDP 1.0 (Potencial Density In Protein). LIGANDSdb to serwis internetwy dostępny pod adresem http://crick.cm-uj.krakow.pl/ligandsdb. LIGANDSdb posiada dwa rodzaje przeszu-kiwania zasobów: przeszukiwanie po nazwach białek dostarczające listy ligandów, które wiąż się z daną proteiną oraz przeszukiwanie po nazwach ligandów którego rezultatem jest lista białek, do których dany ligand się wiąże. Dodatkowo przy każdym białku załączona jest informacja o pełnionej funkcji biologicznej oraz o kodzie EC białka jeżeli kod taki posiada. Serwis ten powstał w oparciu o bazę danych PDB, a konkretnie w oparciu o ok. 25 tys. struktur kompleksów białko ligand. PDP 1.0 to program do analizy rozkładów oddziaływań w białku z naciskiem na ob-szar miejsca wiążącego ligand.
Czytaj nas na:
KrainaKsiazek.PL - Księgarnia Internetowa
