Our work is a contribution towards understanding the biology of mobile genetic elements (MGE). These constitute a significant proportion of most eukaryotic genomes. We demonstrate the presence of signals at the sites where mobile genetic elements preferentially insert in several genomes. These signals have been mapped into a general machine learning protocol. A web enabled computational protocol for the analysis of mobile genetic elements and their insertion sites, and a resource base containing several genomes,termed ELAN has been developed. This suite of tools for analysis and a relational...

Text Mining oder Data Mining ist ein Werkzeug zur Wissensentdeckung, das sich auf den Prozess der Extraktion interessanter und nicht-trivialer Muster aus einer Datenbank mit unstrukturierten Texten bezieht. Hier stellen wir ein neues maschinelles Lernsystem vor, das biologische Datensätze (Textdaten/wissenschaftliche Literatur) auswertet, um Beziehungen zwischen zwei Genen (zwei Begriffen) in einem wissenschaftlichen Text zu verstehen. Das System ahmt die menschliche Intelligenz nach und bestimmt genau die Beziehungen zwischen zwei Genen/Proteinen. Wir haben Literaturdatensätze manuell mit...

L'exploration de textes ou de données est un outil de découverte de connaissances qui se réfère au processus d'extraction de modèles intéressants et non triviaux à partir d'une base de données de textes non structurés. Nous présentons ici un nouveau système d'apprentissage automatique permettant d'explorer des ensembles de données biologiques (données textuelles/littérature scientifique) afin de comprendre les relations entre deux gènes (deux termes) dans un texte scientifique. Le système imite l'intelligence humaine et détermine avec précision les relations entre deux...