As more chloroplast genomes are sequenced their comparative analysis helps to identify conservedness between genomes and provide evidence on the evolutionary history of organisms. In order to increase the significance of similarity search, we defined three new parameters; Cumulative Sum of Homologs (CSH), Actual Proportion of Homologs (APH) and Homology Impact (HI) for post BLAST analysis. These parameters can also be used in other similarity search tools and are useful to identify unbiased conservation between genomes. Moreover, our work demonstrates use of missing data in phylogenetic...

Die genetische Vielfalt bleibt der grundlegende Schritt zur Verbesserung der Pflanzen im Zeitalter der Genomik. Das Verständnis der Struktur der Diversität ist nicht nur eine Voraussetzung für die systematische Probenahme des Keimplasmas, sondern hilft auch bei der Entwicklung geeigneter Erhaltungsstrategien. Syzygium cumini (Black Berry) ist ein großer immergrüner Mehrzweckbaum der Familie Myrtaceae. Der in Indien beheimatete Baum gedeiht leicht im tropischen Klima und kommt in vielen Teilen Asiens und Ostafrikas vor. S. cumini wird weltweit häufig zur Behandlung von Diabetes...

La diversité génétique reste l'étape fondamentale de l'amélioration des plantes à l'ère de la génomique. Comprendre comment la diversité est structurée n'est pas seulement une condition préalable à l'échantillonnage systématique du matériel génétique, mais aide également à concevoir des stratégies de conservation appropriées. Syzygium cumini (Black Berry) est un grand arbre polyvalent à feuilles persistantes de la famille des Myrtacées. L'arbre qui est originaire de l'Inde se développe facilement dans un climat tropical et se trouve dans de nombreuses régions d'Asie...