Repetitive Elemente aus hochfragmentierten Sequenzdaten : Vorhersage und experimenteller Nachweis

ISBN-13: 9783639132564 / Niemiecki / Miękka / 2009 / 96 str.

Alexander Breit

Opis

Inhalt dieser Arbeit ist die Evaluierung undAnwendung einer selbstentwickelten in silico Methodezur Vorhersage repetitiver Einheiten in Whole GenomeShotgun Sequenzdaten. Diese auf BLAST basierendeMethode kann durch Intervallclustering undAssemblierung homologer Sequenzen Repeatswiederherstellen, die selbst länger sind als dieEingabesequenzen. Damit konnten die typisch repetitivvorkommenden Elemente im Genom rekonstruiert werden,wie unter anderem strukturelle RNAs, Histone,Transposons und Retrotransposons aber auch SimpleRepeats und tRNAs.

O autorze

Geboren in Hermannstadt/Rumänien.
1990, im Alter von 13 Jahren mit den Eltern nach Stuttgart
ausgewandert.
Studium der Bioinformatik an der Eberhard-Karls Universität Tübingen.
Diplomarbeit am Max-Planck-Institut für Entwicklungsbiologie,
Tübingen.