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Passage
ISBN-13: 9783639360691 / Niemiecki / Miękka / 2011 / 120 str.
Die Entwicklung und Einfuhrung von Next-Generation Sequencing-Technologien verandern die Moglichkeiten fur Transkriptomstudien immens. Mit der Leistungsfahigkeit der momentanen Sequenziertechnologien konnen Millionen von Sequenzen in kurzester Zeit sequenziert werden. Mit PASSAGE wird in diesem Buch ein Verfahren zur genomweiten Genexpressionsanalyse ohne ein Referenzgenom vorgestellt. Neben der Analyse von Einzelzellen wird aufgezeigt wie mit PASSAGE auch die Analyse von Metatranskriptomen moglich ist. Ist ein Referenzgenom vorhanden so kann mit PASSAGE der Aufwand der Betrachtung der einzelnen Sequenzen mit eben diesem Verfahren deutlich reduziert werden. Neben der reinen Analyse der Daten wird zudem eine grafische Benutzeroberflache zur Visualisierung der Ergebnisse vorgestellt. Damit wird dem Anwender eine ausserst effiziente Analyse der Daten ermoglicht. Der Vergleich mit Microarray-Ergebnissen zeigt die Validitat dieses Verfahrens zur genomweiten Genexpressionsanalyse an Einzelzellen oder von Metatranskriptomen."
Die Entwicklung und Einführung von Next-Generation Sequencing-Technologien verändern die Möglichkeiten für Transkriptomstudien immens. Mit der Leistungsfähigkeit der momentanen Sequenziertechnologien können Millionen von Sequenzen in kürzester Zeit sequenziert werden. Mit PASSAGE wird in diesem Buch ein Verfahren zur genomweiten Genexpressionsanalyse ohne ein Referenzgenom vorgestellt. Neben der Analyse von Einzelzellen wird aufgezeigt wie mit PASSAGE auch die Analyse von Metatranskriptomen möglich ist. Ist ein Referenzgenom vorhanden so kann mit PASSAGE der Aufwand der Betrachtung der einzelnen Sequenzen mit eben diesem Verfahren deutlich reduziert werden. Neben der reinen Analyse der Daten wird zudem eine grafische Benutzeroberfläche zur Visualisierung der Ergebnisse vorgestellt. Damit wird dem Anwender eine äußerst effiziente Analyse der Daten ermöglicht. Der Vergleich mit Microarray-Ergebnissen zeigt die Validität dieses Verfahrens zur genomweiten Genexpressionsanalyse an Einzelzellen oder von Metatranskriptomen.
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