Montagem e finalização de genomas procariotos com mapeamento óptico : Um guia para montagem de genomas de alta precisão

ISBN-13: 9783330728318 / Portugalski / Miękka / 2016 / 76 str.

Diego CB Mariano; Rommel TJ Ramos; Vasco AC Azevedo

Opis

A constante melhoria das plataformas de sequenciamento de DNA vem reduzindo o tempo gasto para o processo de leitura e identificação de genomas a um custo cada vez menor. Porém, os sequenciadores ainda apresentam limitações, como por exemplo, o tamanho de fragmentos de DNA que são capazes de identificar. Assim, o DNA é fragmentado antes do sequenciamento, e após essa etapa, reordenado de forma que possa representar o genoma original. Esse processo, conhecido como montagem de genomas, necessita do uso de diversas estratégias in vitro e in silico. Nos últimos anos, diversas estratégias para montagem de genomas têm sido propostas, entretanto ainda não existe um consenso sobre qual a melhor abordagem. Recentemente, diversos genomas têm sido finalizados a partir de uma técnica conhecida como mapeamento óptico de genoma completo (WGM). Essa técnica permite montagens de grande qualidade a partir de um mapa de restrição de alta precisão. O mapa de restrição permite que contigs sejam orientados e ordenados sem a necessidade de um genoma referência. Mapeamento óptico permitirá a ascensão de uma nova era de montagens de genomas mais rápidas, de menor custo e cada vez mais precisas.

O autorze

Diego Mariano atualmente cursa doutorado em Bioinformática na Universidade Federal de Minas Gerais. Possui mestrado em Bioinformática e bacharelado em Sistemas de Informação. Tem experiência em desenvolvimento de sistemas Web, habilidade em programação com as linguagens PHP, Python e Perl, além de conhecimentos na área de Bioinformática.