Aplicação de Algoritmo genético no mapeamento de genes epistáticos : Experimental em Cruzamentos Controlados

ISBN-13: 9783330766464 / Portugalski / Miękka / 2017 / 244 str.

Paulo Oliveira

Opis

Este livro descreve um método geral para melhorar a eficiência computacional em mapeamento simultâneo de múltiplos QTL's e de seus efeitos de interação. A literatura tem usado métodos de busca exaustiva ou busca condicional. O Autor propõe o uso do algoritmo genético para pesquisar o espaço multilocos, sendo este mais útil para genomas maiores e mapas densos de marcadores moleculares. Por meio de estudos de simulações, o autor mostra que a busca baseada no algoritmo genético tem eficiência, em geral, mais alta que aquela de um método de busca condicional e que esta eficiência é comparável àquela de uma busca exaustiva. Na formalização do algoritmo genético é pesquisado o comportamento de parâmetros tais como: probabilidade de recombinação, probabilidade de mutação, tamanho amostral, quantidade de gerações, quantidade de soluções e tamanho do genoma, para diferentes funções objetivo: BIC, AIC e SSE, a soma de quadrados dos resíduos de um modelo ajustado. A aplicação das metodologias propostas é também considerada na análise de um conjunto de dados genotípicos e fenotípicos de ratos provenientes de um delineamento F2.

O autorze

Pesquisador na área de Probabilidade, Estatística e aplicações. Bacharel em Estatística IME-USP (1997). Mestrado em Estatística IME-USP (2001). Doutorado em Estatística IME -USP2 (2008). Pós-doutorado em Tecnologia nuclear e aplicações no IPEN/CNEN - SP (2011). Pós-doutorado em Engenharia de Transportes na EESC/STT - USP desde 2015.